Đầu thế kỷ XX, thời Pháp thuộc, Hua Bum nằm trong khu Mường Boum châu Quỳnh Nhai tỉnh Lai Châu xứ Bắc Kỳ, Liên bang Đông Dương thuộc Pháp. Khu Mường Boum châu Quỳnh Nhai khi đó gồm các xã: Ban Nam Cao (扳南高, nay thuộc xã Hua Bum), Ta Tung (馱蹤, tức Ta Leng Po, nay thuộc Hua Bum), Ban Na Trát (扳那扎, nay thuộc Bum Nưa), Mường Boum, Mường Mò (猛摸, nay là Mường Mô).[9]

Trước đây, xã Hua Bum thuộc huyện Mường Tè. Ngày 2 tháng 11 năm 2012, xã chuyển sang trực thuộc huyện Nậm Nhùn mới thành lập.[7]